Во 2 сезоне сериала Исправление и наказание Алёна Неверова сталкивается с ещё большими трудностями в своей работе начальника колонии. Новый начальник колонии, не разделяющий её взгляды на исправление преступников, становится главным антагонистом сезона. Вместе с ним приходят новые проблемы, связанные с управлением и перевоспитанием осуждённых. Алёна старается сохранить баланс между своими принципами и требованиями системы.
Сюжет второго сезона погружает зрителей в мир конфликтов между идеализмом и реалиями исправительной системы, показывая, как герои меняются под давлением обстоятельств. Этот сезон добавляет новых персонажей и развивает драматические линии первых серий.